Он открылся в декабре 1956 года. В 1966 году у здания появилась пристройка, где разместился первый в республике закрытый плавательный бассейн. С 1995 года бассейн Республиканского дома физкультуры находился на реконструкции, а в 2001 году он открылся под названием «Водно-спортивный центр Акватика». В 2006 году после реконструкции открылся и сам Дом физкультуры.
На долгие годы Дом физкультуры стал основной тренировочной базой для сборных команд Карелии по баскетболу, волейболу, борьбе, боксу, гандболу, художественной гимнастике, лёгкой атлетике, плаванию, спортивной гимнастике.